SIPD-RI sebagai aplikasi terpusat tidak memungkinkan Pemda pengguna untuk memiliki kendali apapun selain sebagai user. Terhadap permasalahan ini sudah disampaikan langsung ke Pusdatin Kemendagri dan dijawab sedang on process untuk penanganannya. Kendala akses SIPD-RI tidak hanya terjadi di Magetan tetapi di juga di seluruh daerah di Jawa Timur serta sebagian besar lainnya. Senyampang menunggu SIPD-RI bisa lancar sebagaimana mestinya, teman-teman SKPD bisa melakukan kertas kerja manual sebagai kendali untuk memastikan bahwa data-data yang nampak di SIPD-RI tidak ada anomali.